Thomas Wiedmer wurde am 23. September 1962 als Bürger von Oberburg (BE) geboren. Nach Abschluss der obligatorischen Schulzeit in Muri-Gümligen absolvierte er das Literargymnasium Bern-Kirchenfeld. Er studierte anschliessend an der Universität Bern Volkswirtschaftslehre und Psychologie und schloss sein Studium 1990 mit einem Lizenziat ab. Danach war er Assistent für Forschung und Lehre am Volkswirtschaftlichen Institut der Universität Bern, Abteilung Angewandte Mikroökonomie, und promovierte zum Dr. rer. pol. mit einer Dissertation in mathematischer Ökonomie. 1994/95 weilte er mit einem Stipendium des Schweizerischen Nationalfonds als Visiting Research Fellow an der University of California in Berkeley (USA).
Nach seiner Rückkehr aus den USA war Thomas Wiedmer bei der Swiss Re als Business Analyst tätig. 1997 wechselte er in die Finanzdirektion des Kantons Bern, wo er als stellvertretender Generalsekretär und Chefökonom amtete.
Thomas Wiedmer wurde auf den 1. Mai 2000 vom Bundesrat zum Stellvertretenden Mitglied des Direktoriums ernannt. Er leitet als Chief Financial Officer die Organisationseinheit Finanzen und Risiken (Risikomanagement, Rechnungswesen und Controlling). Als Vertreter der SNB war er von 2007 bis 2012 Mitglied des Basler Ausschusses für Bankenüberwachung (Basel Committee on Banking Supervision) und Mitvorsitzender der Working Group on Liquidity.
Des Weiteren ist Thomas Wiedmer Präsident des Stiftungsrats des «hasli-zentrum» der SNB und Mitglied des Stiftungsrats des Studienzentrums Gerzensee. Das «hasli-zentrum» wie auch das Studienzentrum Gerzensee gehören der Schweizerischen Nationalbank an. Ausserhalb der SNB führt Thomas Wiedmer keine Verwaltungs- und Beratungsmandate.
Thomas Wiedmer hat seit 2001 einen Lehrauftrag an der Universität Bern und hält Vorlesungen zum Thema Gleichgewicht, Kapital und Wachstum. Er hat in international renommierten Zeitschriften eine Reihe von theoretisch und empirisch orientierten Artikeln auf verschiedenen Gebieten der Ökonomie publiziert. Thomas Wiedmer wurde von der Universität Bern per 1. Mai 2012 zum Titularprofessor ernannt.
Thomas Wiedmer ist verheiratet und Vater von zwei Kindern.